梯度PCR擴增儀是由普通PCR儀衍生出的帶梯度PCR功能的基因擴增儀。適用于分子生物學、醫學、食品工業、司法科學、生物技術、環境科學、微生物學、臨床診斷、流行病學、遺傳學、基因芯片、基因檢測、基因克隆、基因表達等領域以聚合酶鏈式反應（Picymerase Chain Reaction,PCR）為特征的、以檢測DNA/RNA為目的的各種病原體檢測及基因分析。
PCR反應能否成功，退火溫度是關鍵，梯度PCR儀每個孔的溫度可以在范圍內按照梯度設置，根據結果，一步就可以摸索出最適反應條件。一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件（通常12種溫度梯度）的稱之為梯度PCR儀。因為被擴增的不同的DNA片段其適合的退火溫度不同，通過設置一系列的梯度退火溫度進行擴增，從而一次性PCR擴增就可以篩選出表達量高的適合退火溫度進行有效的擴增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增，這樣可節省試驗時間、提高實驗效率，又節約實驗成本。在不設置梯度的情況下亦可當做普通的PCR用。梯度PCR儀多應用于科研、教學機構。
梯度PCR擴增儀的日常維護保養工作：
1、樣品池的清洗
先打開蓋子，然后用95%乙醇或10%清洗液浸泡樣品池5min，然后清洗被污染的孔；用微量移液器吸取液體，用棉簽吸干剩余液體，設定保持溫度為50℃的PCR程序并使之運行，讓殘余液體揮發去除，一般5～10min即可。
2、熱蓋的清洗
對于熒光定量基因擴增儀，當有熒光污染出現，而且這一污染并非來自樣品池時，或當有污染或殘跡物影響到熱蓋的松緊時，需要用壓縮空氣或純水清洗墊蓋底面，確保樣品池的孔干凈，無污物阻擋光路。
3、儀器外表面的清洗
清洗梯度PCR擴增儀的外表面可以除去灰塵和油脂，但達不到消毒的效果，選擇沒有腐蝕性的清洗劑對基因擴增儀的外表面進行清洗。
4、更換保險絲
先將基因擴增儀關機，拔去插頭，打開電源插口旁邊的保險盒，換上備用的保險絲，觀察是否恢復正常。
